Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20425E9Q035 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms