Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Soga1E1U8D0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Soga1E1U8D0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms