Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6P9

Ddx43, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 43, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx43D3Z6P9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ddx43D3Z6P9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx43D3Z6P9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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