Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vpreb3D3Z6J4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb3D3Z6J4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms