Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms