Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam47eD3YWC7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam47eD3YWC7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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