Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rfx8D3YU81 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rfx8D3YU81 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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