Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17333C6EQI3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17333C6EQI3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17333C6EQI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm17333C6EQI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm17333C6EQI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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