Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdzd8B9EJ80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms