Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20547B8JJN0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20547B8JJN0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm20547B8JJN0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm20547B8JJN0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm20547B8JJN0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20547B8JJN0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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