Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf11cB4XVP9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf11cB4XVP9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms