Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otud7bB2RUR8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms