Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usf3B2RUQ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usf3B2RUQ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usf3B2RUQ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usf3B2RUQ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usf3B2RUQ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usf3B2RUQ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usf3B2RUQ2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms