Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud4B2RRE7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud4B2RRE7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud4B2RRE7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms