Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf3B2KF05 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brpf3B2KF05 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms