Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssxb8B1AY40 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ssxb8B1AY40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ssxb8B1AY40 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssxb8B1AY40 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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