Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef20B1ARV6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pramef20B1ARV6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms