Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slfn8B1ARD8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slfn8B1ARD8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms