Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3173A6NAS3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3173A6NAS3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms