Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttll11A4Q9F4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttll11A4Q9F4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms