Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samt1A2BED8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Samt1A2BED8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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