Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ism1A2ATD1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms