Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Patl2A2ARM1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms