Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubb1A2AQ07 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms