Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syndig1A2ANU3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syndig1A2ANU3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms