Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GabreA2AMW3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GabreA2AMW3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms