Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm12A2AJ77 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms