Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ambra1A2AH22 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ambra1A2AH22 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ambra1A2AH22 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms