Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frmpd4A2AFR3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Frmpd4A2AFR3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms