Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms