Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0U1RNP2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0U1RNP2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms