Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms