Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
B020011L13RikA0A087WQI7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B020011L13RikA0A087WQI7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms