Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SNX13Q9Y5W8 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SNX13Q9Y5W8 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SNX13Q9Y5W8 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
SNX13Q9Y5W8 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
SNX13Q9Y5W8 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
SNX13Q9Y5W8 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
SNX13Q9Y5W8 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
SNX13Q9Y5W8 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.84□□□□□ -3.18
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.86□□□□□ -3.19
SNX13Q9Y5W8 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.2 ms