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Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16
SPOCK3, Testican-3, human
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436 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP106-201
ENST00000517274
100 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.657-201
ENST00000515983
102 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1247P-201
ENST00000516622
98 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-119P-201
ENST00000364882
107 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SPOCK3
Q9BQ16
MIR496-201
ENST00000385226
102 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.658-201
ENST00000515990
97 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.511-201
ENST00000384514
103 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.15-201
ENST00000362420
102 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P13-201
ENST00000384284
96 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P7-201
ENST00000364600
96 nt
BASIC
-1.78
□□□□□ -2.69
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.403-201
ENST00000383977
101 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1191P-201
ENST00000516799
107 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-803P-201
ENST00000516034
102 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
SPOCK3
Q9BQ16
SNORD54-201
ENST00000459159
67 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP93-201
ENST00000362525
114 nt
BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
101 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
-2.04
□□□□□ -2.74
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.520-201
ENST00000384556
102 nt
BASIC
-2.12
□□□□□ -2.75
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.186-201
ENST00000363899
92 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
SPOCK3
Q9BQ16
hsa-mir-550a-2.1-201
ENST00000637473
97 nt
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1121P-201
ENST00000516802
109 nt
BASIC
-2.38
□□□□□ -2.79
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.566-201
ENST00000384735
101 nt
BASIC
-2.4
□□□□□ -2.79
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1128P-201
ENST00000362825
109 nt
BASIC
-2.58
□□□□□ -2.82
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