Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-6.36□□□□□ -3.43
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-6.38□□□□□ -3.43
RTL8BQ17RB0 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-6.39□□□□□ -3.43
RTL8BQ17RB0 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-6.44□□□□□ -3.44
RTL8BQ17RB0 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-6.45□□□□□ -3.44
RTL8BQ17RB0 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
RTL8BQ17RB0 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-6.53□□□□□ -3.45
RTL8BQ17RB0 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
RTL8BQ17RB0 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
RTL8BQ17RB0 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
RTL8BQ17RB0 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-6.66□□□□□ -3.48
RTL8BQ17RB0 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-6.77□□□□□ -3.49
RTL8BQ17RB0 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-6.93□□□□□ -3.52
RTL8BQ17RB0 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-7.05□□□□□ -3.54
RTL8BQ17RB0 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-7.16□□□□□ -3.56
RTL8BQ17RB0 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-7.24□□□□□ -3.57
RTL8BQ17RB0 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-7.25□□□□□ -3.57
RTL8BQ17RB0 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-7.41□□□□□ -3.6
RTL8BQ17RB0 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-7.46□□□□□ -3.6
RTL8BQ17RB0 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-7.63□□□□□ -3.63
RTL8BQ17RB0 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-7.67□□□□□ -3.64
RTL8BQ17RB0 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-7.67□□□□□ -3.64
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-7.91□□□□□ -3.68
RTL8BQ17RB0 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-7.99□□□□□ -3.69
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.3 ms