Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PTPRNQ16849 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PTPRNQ16849 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PTPRNQ16849 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRNQ16849 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRNQ16849 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRNQ16849 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRNQ16849 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRNQ16849 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
PTPRNQ16849 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
PTPRNQ16849 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
PTPRNQ16849 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
PTPRNQ16849 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRNQ16849 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PTPRNQ16849 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PTPRNQ16849 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PTPRNQ16849 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRNQ16849 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRNQ16849 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPRNQ16849 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PTPRNQ16849 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPRNQ16849 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
PTPRNQ16849 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.5 ms