Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
PTPROQ16827 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPROQ16827 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPROQ16827 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPROQ16827 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPROQ16827 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPROQ16827 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPROQ16827 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPROQ16827 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPROQ16827 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PTPROQ16827 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PTPROQ16827 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPROQ16827 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
PTPROQ16827 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
PTPROQ16827 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
PTPROQ16827 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
PTPROQ16827 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
PTPROQ16827 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
PTPROQ16827 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 235 ms