Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
DDB1Q16531 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
DDB1Q16531 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
DDB1Q16531 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
DDB1Q16531 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
DDB1Q16531 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
DDB1Q16531 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
DDB1Q16531 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
DDB1Q16531 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
DDB1Q16531 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
DDB1Q16531 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
DDB1Q16531 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
DDB1Q16531 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
DDB1Q16531 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
DDB1Q16531 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
DDB1Q16531 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
DDB1Q16531 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
DDB1Q16531 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
DDB1Q16531 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
DDB1Q16531 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
DDB1Q16531 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
DDB1Q16531 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
DDB1Q16531 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
DDB1Q16531 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 5.8 ms