Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CNN3Q15417 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CNN3Q15417 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CNN3Q15417 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
CNN3Q15417 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
CNN3Q15417 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CNN3Q15417 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
CNN3Q15417 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CNN3Q15417 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
CNN3Q15417 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
CNN3Q15417 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CNN3Q15417 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CNN3Q15417 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
CNN3Q15417 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
CNN3Q15417 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
CNN3Q15417 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
CNN3Q15417 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
CNN3Q15417 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CNN3Q15417 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CNN3Q15417 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CNN3Q15417 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CNN3Q15417 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CNN3Q15417 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CNN3Q15417 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.81□□□□□ -3.18
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.5 ms