Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CKAP5Q14008 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CKAP5Q14008 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CKAP5Q14008 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CKAP5Q14008 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CKAP5Q14008 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CKAP5Q14008 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CKAP5Q14008 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CKAP5Q14008 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CKAP5Q14008 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CKAP5Q14008 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CKAP5Q14008 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CKAP5Q14008 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CKAP5Q14008 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CKAP5Q14008 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CKAP5Q14008 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CKAP5Q14008 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CKAP5Q14008 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CKAP5Q14008 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CKAP5Q14008 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
CKAP5Q14008 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
CKAP5Q14008 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
CKAP5Q14008 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CKAP5Q14008 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 2.9 ms