Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PKP1Q13835 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
PKP1Q13835 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
PKP1Q13835 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
PKP1Q13835 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
PKP1Q13835 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
PKP1Q13835 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
PKP1Q13835 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PKP1Q13835 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PKP1Q13835 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PKP1Q13835 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PKP1Q13835 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PKP1Q13835 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PKP1Q13835 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
PKP1Q13835 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
PKP1Q13835 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PKP1Q13835 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
PKP1Q13835 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
PKP1Q13835 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 489 ms