Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.61□□□□□ -3.31
TMED1Q13445 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
TMED1Q13445 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
TMED1Q13445 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
TMED1Q13445 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-5.66□□□□□ -3.32
TMED1Q13445 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
TMED1Q13445 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
TMED1Q13445 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TMED1Q13445 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
TMED1Q13445 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TMED1Q13445 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TMED1Q13445 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TMED1Q13445 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TMED1Q13445 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-6.26□□□□□ -3.41
TMED1Q13445 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-6.29□□□□□ -3.42
TMED1Q13445 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-6.32□□□□□ -3.42
TMED1Q13445 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-6.47□□□□□ -3.45
TMED1Q13445 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-6.48□□□□□ -3.45
TMED1Q13445 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-6.58□□□□□ -3.46
TMED1Q13445 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-6.62□□□□□ -3.47
TMED1Q13445 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-6.65□□□□□ -3.47
TMED1Q13445 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-6.73□□□□□ -3.49
TMED1Q13445 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-7.1□□□□□ -3.55
TMED1Q13445 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-7.1□□□□□ -3.55
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 3.4 ms