Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
ERCC8Q13216 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
ERCC8Q13216 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
ERCC8Q13216 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
ERCC8Q13216 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
ERCC8Q13216 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
ERCC8Q13216 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ERCC8Q13216 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ERCC8Q13216 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
ERCC8Q13216 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ERCC8Q13216 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ERCC8Q13216 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
ERCC8Q13216 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ERCC8Q13216 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ERCC8Q13216 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ERCC8Q13216 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ERCC8Q13216 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ERCC8Q13216 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ERCC8Q13216 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
ERCC8Q13216 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
ERCC8Q13216 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
ERCC8Q13216 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
ERCC8Q13216 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
ERCC8Q13216 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms