Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRAF3Q13114 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRAF3Q13114 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRAF3Q13114 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAF3Q13114 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TRAF3Q13114 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TRAF3Q13114 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
TRAF3Q13114 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
TRAF3Q13114 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
TRAF3Q13114 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
TRAF3Q13114 RNU6-892P-201ENST00000410335 99 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRAF3Q13114 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRAF3Q13114 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRAF3Q13114 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRAF3Q13114 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
TRAF3Q13114 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
Retrieved 24 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms