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Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16
SPOCK3, Testican-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SPOCK3
Q9BQ16
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103 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
SPOCK3
Q9BQ16
SNORD83B-201
ENST00000386745
93 nt
BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.652-201
ENST00000458902
102 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4748-201
ENST00000578076
82 nt
BASIC
-0.49
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
MIR548AX-201
ENST00000580117
73 nt
BASIC
-0.5
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
MIR378F-201
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78 nt
BASIC
-0.51
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-226P-201
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107 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.612-201
ENST00000410717
95 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4756-201
ENST00000577874
78 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
SOX2OT_exon4.1-201
ENST00000610449
109 nt
BASIC
-0.52
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
RNU4-63P-201
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118 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
AC108019.1-201
ENST00000512540
175 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
MIR3681-201
ENST00000580089
72 nt
BASIC
-0.53
□□□□□ -2.49
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.457-201
ENST00000384237
111 nt
BASIC
-0.55
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
MIRLET7A3-201
ENST00000362116
74 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-118P-201
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102 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4306-201
ENST00000583390
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BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
RNU4-85P-201
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123 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.502-201
ENST00000384478
113 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
SNX3P1Y-201
ENST00000615757
176 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
MT-TQ-201
ENST00000387372
72 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P9-201
ENST00000363194
97 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.165-201
ENST00000363721
102 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
SNX3P1X-201
ENST00000414887
175 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
SCARNA17-201
ENST00000516183
144 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP449-201
ENST00000516871
130 nt
BASIC
-0.65
□□□□□ -2.51
SPOCK3
Q9BQ16
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.284-201
ENST00000364806
102 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
MIR664B-201
ENST00000626756
61 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P25-201
ENST00000459254
96 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
SPOCK3
Q9BQ16
SNORD18.1-201
ENST00000363807
70 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4723-201
ENST00000585070
81 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.513-201
ENST00000384522
100 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-194P-201
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105 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
MIR5693-201
ENST00000577722
73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-0.79
□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
SNORD114-13-201
ENST00000364377
74 nt
BASIC
-0.8
□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
MIR587-201
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96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.55-201
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102 nt
BASIC
-0.83
□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.79-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.266-201
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96 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4324-201
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72 nt
BASIC
-0.84
□□□□□ -2.54
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-10P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6ATAC32P-201
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76 nt
BASIC
-0.85
□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1044P-201
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107 nt
BASIC
-0.86
□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
MIR601-201
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79 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
MIR3115-201
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68 nt
BASIC
-0.89
□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
MIR198-201
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BASIC
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□□□□□ -2.55
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.468-201
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BASIC
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□□□□□ -2.56
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4320-201
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BASIC
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□□□□□ -2.56
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-230P-201
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BASIC
-0.96
□□□□□ -2.56
SPOCK3
Q9BQ16
MIR3165-201
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BASIC
-0.98
□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-1306P-201
ENST00000365219
99 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
VTRNA2-1-201
ENST00000602301
127 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-1
□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.830-201
ENST00000628531
96 nt
BASIC
-1.01
□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.232-201
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96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.442-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP461-201
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□□□□□ -2.57
SPOCK3
Q9BQ16
U4.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.413-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.754-201
ENST00000476024
102 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.790-201
ENST00000614282
102 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.782-201
ENST00000614695
102 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-665P-201
ENST00000384639
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BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
MIR1207-201
ENST00000408249
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BASIC
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□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
MIR3139-201
ENST00000579145
76 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.397-201
ENST00000383950
98 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
SPOCK3
Q9BQ16
MIR1285-2-201
ENST00000408311
88 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
SPOCK3
Q9BQ16
MIR365A-201
ENST00000362260
87 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
SPOCK3
Q9BQ16
SNORD114-3-201
ENST00000364969
75 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.181-201
ENST00000363872
101 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
SPOCK3
Q9BQ16
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
SPOCK3
Q9BQ16
MIR4441-201
ENST00000582623
100 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
SPOCK3
Q9BQ16
RNA5SP180-201
ENST00000516181
101 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
SPOCK3
Q9BQ16
MIR1246-201
ENST00000636535
73 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P19-201
ENST00000362530
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.543-201
ENST00000384649
107 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
SPOCK3
Q9BQ16
RNU6-916P-201
ENST00000516088
109 nt
BASIC
-1.31
□□□□□ -2.62
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.225-201
ENST00000364326
97 nt
BASIC
-1.32
□□□□□ -2.62
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.616-201
ENST00000410835
95 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P27-201
ENST00000363341
96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.63
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.684-201
ENST00000516510
99 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
SPOCK3
Q9BQ16
MIR509-1-201
ENST00000385265
94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.64
SPOCK3
Q9BQ16
MIR509-2-201
ENST00000390724
91 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.53-201
ENST00000362765
102 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
SPOCK3
Q9BQ16
MIR363-201
ENST00000384840
75 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.475-201
ENST00000384345
101 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
SPOCK3
Q9BQ16
RNY4P10-201
ENST00000365571
96 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
SPOCK3
Q9BQ16
Y_RNA.228-201
ENST00000364346
98 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
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