Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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ATG3Q9NT62 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATG3Q9NT62 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATG3Q9NT62 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATG3Q9NT62 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATG3Q9NT62 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATG3Q9NT62 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATG3Q9NT62 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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ATG3Q9NT62 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATG3Q9NT62 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATG3Q9NT62 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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ATG3Q9NT62 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATG3Q9NT62 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATG3Q9NT62 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATG3Q9NT62 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATG3Q9NT62 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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ATG3Q9NT62 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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ATG3Q9NT62 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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ATG3Q9NT62 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATG3Q9NT62 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATG3Q9NT62 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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ATG3Q9NT62 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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ATG3Q9NT62 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATG3Q9NT62 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ATG3Q9NT62 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ATG3Q9NT62 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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