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Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6
NIN, Ninein, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NIN
Q8N4C6
AC139453.2-201
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BASIC
-3.45
□□□□□ -2.96
NIN
Q8N4C6
MIR568-201
ENST00000385036
95 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
NIN
Q8N4C6
RNU7-200P-201
ENST00000516105
62 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
NIN
Q8N4C6
SCARNA15.1-201
ENST00000516384
125 nt
BASIC
-3.47
□□□□□ -2.96
NIN
Q8N4C6
RNU6-422P-201
ENST00000384632
107 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-380P-201
ENST00000410207
107 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
MIR4801-201
ENST00000582704
82 nt
BASIC
-3.48
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-659P-201
ENST00000516454
104 nt
BASIC
-3.49
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.219-201
ENST00000364232
113 nt
BASIC
-3.5
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-1134P-201
ENST00000365156
101 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-675P-201
ENST00000384236
104 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
MIR4484-201
ENST00000582855
83 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-836P-201
ENST00000362920
107 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
SNORD116-24-201
ENST00000384549
92 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
MIR1302-5-201
ENST00000408164
150 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-1043P-201
ENST00000410355
99 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-109P-201
ENST00000516364
107 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-184P-201
ENST00000516514
107 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
MIR548X-201
ENST00000580069
75 nt
BASIC
-3.51
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-379P-201
ENST00000363813
104 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-776P-201
ENST00000364403
104 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNU6-1022P-201
ENST00000365049
104 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
RNA5SP449-201
ENST00000516871
130 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.97
NIN
Q8N4C6
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
LEKR1-212
ENST00000640869
237 nt
TSL 5
BASIC
-3.53
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
SNORA63.4-201
ENST00000362763
126 nt
BASIC
-3.54
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-3.54
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.506-201
ENST00000384494
102 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
SNORD115.2-201
ENST00000391126
59 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
RNU6-219P-201
ENST00000364728
107 nt
BASIC
-3.55
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.335-201
ENST00000365299
96 nt
BASIC
-3.56
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
-3.57
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
MIR3938-201
ENST00000582157
103 nt
BASIC
-3.57
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
RNU6-895P-201
ENST00000384125
103 nt
BASIC
-3.58
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
MT-TG-201
ENST00000387429
68 nt
BASIC
-3.58
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
RNU6-327P-201
ENST00000516270
127 nt
BASIC
-3.58
□□□□□ -2.98
NIN
Q8N4C6
TRGJP-201
ENST00000390338
61 nt
APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
RNU6-907P-201
ENST00000390924
102 nt
BASIC
-3.61
□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
-3.63
□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
MIR548AL-201
ENST00000578416
97 nt
BASIC
-3.63
□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
MIR450A1-201
ENST00000362262
91 nt
BASIC
-3.64
□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
SNORD116-14-201
ENST00000383894
92 nt
BASIC
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NIN
Q8N4C6
SNORD116-17-201
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92 nt
BASIC
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Q8N4C6
SNORD116-15-201
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BASIC
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Q8N4C6
SNORD116-19-201
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92 nt
BASIC
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NIN
Q8N4C6
RNU6-663P-201
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BASIC
-3.64
□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.406-201
ENST00000383984
100 nt
BASIC
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NIN
Q8N4C6
RNU6-411P-201
ENST00000384451
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
AL031737.1-201
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
SOX2OT_exon4.1-201
ENST00000610449
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
RNU6-589P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.99
NIN
Q8N4C6
RNU6-808P-201
ENST00000391233
108 nt
BASIC
-3.67
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
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BASIC
-3.67
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
RNU6-1008P-201
ENST00000384160
104 nt
BASIC
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□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
RNU6-844P-201
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BASIC
-3.68
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.165-201
ENST00000363721
102 nt
BASIC
-3.7
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
RNU6-1045P-201
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BASIC
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□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.722-201
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BASIC
-3.71
□□□□□ -3
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Q8N4C6
RNU6-1212P-201
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104 nt
BASIC
-3.71
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
AL117351.2-201
ENST00000513571
157 nt
BASIC
-3.72
□□□□□ -3
NIN
Q8N4C6
RNU6-959P-201
ENST00000384671
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BASIC
-3.73
□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.565-201
ENST00000384719
101 nt
BASIC
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□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
AC008267.6-201
ENST00000441664
139 nt
BASIC
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NIN
Q8N4C6
RNU6-1131P-201
ENST00000364955
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
Y_RNA.73-201
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
Y_RNA.345-201
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
RNU6-1255P-201
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112 nt
BASIC
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NIN
Q8N4C6
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BASIC
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□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
SNORA25.4-201
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124 nt
BASIC
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□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
RNY1P5-201
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115 nt
BASIC
-3.76
□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
RNU6-886P-201
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105 nt
BASIC
-3.77
□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.788-201
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BASIC
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□□□□□ -3.01
NIN
Q8N4C6
RNU6-1056P-201
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
RNU6ATAC23P-201
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BASIC
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□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
RNU6-255P-201
ENST00000516957
105 nt
BASIC
-3.79
□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
RNU6-346P-201
ENST00000516288
111 nt
BASIC
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□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
MIR4503-201
ENST00000582187
83 nt
BASIC
-3.81
□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
MIR4712-201
ENST00000583750
82 nt
BASIC
-3.83
□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
MIR1245B-201
ENST00000636115
69 nt
BASIC
-3.84
□□□□□ -3.02
NIN
Q8N4C6
RNU6-916P-201
ENST00000516088
109 nt
BASIC
-3.85
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
MIR4511-201
ENST00000582784
87 nt
BASIC
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□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
RNU4-33P-201
ENST00000364316
85 nt
BASIC
-3.85
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
RNU6-122P-201
ENST00000516818
107 nt
BASIC
-3.86
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
MIR5588-201
ENST00000581890
63 nt
BASIC
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□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
AC090425.1-201
ENST00000610007
140 nt
BASIC
-3.86
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-3.87
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
RNU6-1326P-201
ENST00000391262
107 nt
BASIC
-3.88
□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
MIR4679-1-201
ENST00000637619
75 nt
BASIC
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□□□□□ -3.03
NIN
Q8N4C6
RNU6-1168P-201
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BASIC
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Q8N4C6
RNU6-634P-201
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BASIC
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NIN
Q8N4C6
Y_RNA.94-201
ENST00000363068
106 nt
BASIC
-3.93
□□□□□ -3.04
NIN
Q8N4C6
RNU6-687P-201
ENST00000516443
89 nt
BASIC
-3.94
□□□□□ -3.04
NIN
Q8N4C6
Y_RNA.316-201
ENST00000365118
111 nt
BASIC
-3.95
□□□□□ -3.04
NIN
Q8N4C6
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-3.96
□□□□□ -3.04
NIN
Q8N4C6
MIR3134-201
ENST00000579433
74 nt
BASIC
-3.97
□□□□□ -3.04
NIN
Q8N4C6
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
-3.98
□□□□□ -3.05
NIN
Q8N4C6
MIR4666B-201
ENST00000578142
81 nt
BASIC
-3.99
□□□□□ -3.05
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