Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
RNF20Q5VTR2 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
RNF20Q5VTR2 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
RNF20Q5VTR2 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RNF20Q5VTR2 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RNF20Q5VTR2 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
RNF20Q5VTR2 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RNF20Q5VTR2 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
RNF20Q5VTR2 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
RNF20Q5VTR2 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
RNF20Q5VTR2 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RNF20Q5VTR2 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms