Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RTN1Q16799 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
RTN1Q16799 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RTN1Q16799 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
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RTN1Q16799 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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RTN1Q16799 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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RTN1Q16799 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTN1Q16799 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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RTN1Q16799 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RTN1Q16799 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RTN1Q16799 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTN1Q16799 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTN1Q16799 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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RTN1Q16799 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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RTN1Q16799 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
RTN1Q16799 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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RTN1Q16799 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
RTN1Q16799 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
RTN1Q16799 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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